RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 DAB2P98082 770 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PSMD2Q13200 908 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 TTLL4Q14679 1199 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 RASIP1Q5U651 963 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 SHISA5Q8N114 240 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.7□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 FAM170BA6NMN3 283 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 SPINK2P20155 84 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ERVK-24P63145 666 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.69□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 NEFMP07197 916 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 FOSL1P15407 271 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CYP27A1Q02318 531 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 TMC4Q7Z404 712 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 LGR6Q9HBX8 967 aa6.68□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 DTX1Q86Y01 620 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 RNF214Q8ND24 703 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ISL2Q96A47 359 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.67□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CDK5R2Q13319 367 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 MSMPQ1L6U9 139 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 FAM161BQ96MY7 647 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.66□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CYP26A1O43174 497 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 PPM1JQ5JR12 505 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CSADQ9Y600 493 aa6.65□□□□□ -1.34
GDE1-202ENST00000563645 CTSHP09668 335 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 NTF4P34130 210 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 LIG3P49916 1009 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 RING1Q06587 406 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CRELD1Q96HD1 420 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PICK1Q9NRD5 415 aa6.64□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 FANCGO15287 622 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 SORBS3O60504 671 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 FAM87AP0C7U9 286 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 LMNB1P20700 586 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ITGAEP38570 1179 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 C12orf40Q86WS4 652 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 MRS2Q9HD23 443 aa6.63□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PRNPP04156 253 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 RLBP1P12271 317 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 MAP3K11Q16584 847 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 HDXQ7Z353 690 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 HOMEZQ8IX15 550 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.62□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 USP31Q70CQ4 1352 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 ADAMTS4O75173 837 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 SEPT6Q14141 434 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 INPP5AQ14642 412 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.61□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 LEFTY1O75610 366 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 WNT11O96014 354 aa6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GDE1-202ENST00000563645 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms