RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-210ENST00000560934 F8W735 103 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 LMNB2Q03252 620 aa6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 DCAF5Q96JK2 942 aa6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.88□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ADAMTS12P58397 1594 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GRIN2AQ12879 1464 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 AOC2O75106 756 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TRIM37O94972 964 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 DRD2P14416 443 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GARTP22102 1010 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 RHOVQ96L33 236 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 NACC1Q96RE7 527 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 WDR18Q9BV38 432 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 RNF208Q9H0X6 261 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 KRT82Q9NSB4 513 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CUL7Q14999 1698 aa6.87□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 MEGF11A6BM72 1044 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 NOS3P29474 1203 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CHRNA4P43681 627 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TNNI2P48788 182 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CDK8P49336 464 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GSK3AP49840 483 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 RASSF7Q02833 373 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CD163Q86VB7 1156 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 SPON2Q9BUD6 331 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CSADQ9Y600 493 aa6.86□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 F13A1P00488 732 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 SLFN14P0C7P3 912 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 GLB1P16278 677 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 KCNMA1Q12791 1236 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ADGRE1Q14246 886 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 INPP5AQ14642 412 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 MBTPS1Q14703 1052 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 FBXO27Q8NI29 283 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.85□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 NUP160Q12769 1436 aa6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 FDX2Q6P4F2 183 aa6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 C12orf40Q86WS4 652 aa6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
LINS1-210ENST00000560934 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 GREM1O60565 184 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 GDF11O95390 407 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 PAK2Q13177 524 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 DYMQ7RTS9 669 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 CAPN10Q9HC96 672 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 UBP1Q9NZI7 540 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 FAM221AA4D161 298 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 TMPRSS2O15393 492 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 ADH5P11766 374 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.82□□□□□ -1.32
LINS1-210ENST00000560934 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms