RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558776.1

MED28P6-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene MED28P6, Length 231 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P6-201ENST00000558776 SPEM2Q0P670 501 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 NEUROD1Q13562 356 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PPP2R5AQ15172 486 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RASIP1Q5U651 963 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 VHLLQ6RSH7 139 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ATL2Q8NHH9 583 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 BSNDQ8WZ55 320 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MUC3BQ9H195 1237 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 EPN3Q9H201 632 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.56□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FAM177BA6PVY3 158 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MEIS3P2A8K0S8 358 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PLIN1O60240 522 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RFPL3O75679 317 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 B3GALT4O96024 378 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SIK1P57059 783 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SCARF1Q14162 830 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PCSK7Q16549 785 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 HPS1Q92902 700 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 GAL3ST3Q96A11 431 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 KIF2CQ99661 725 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MARK1Q9P0L2 795 aa4.55□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 A0A087X0B3 334 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PLD2O14939 933 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SUSD5O60279 629 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 CAND2O75155 1236 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 GPLD1P80108 840 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ATP11AP98196 1134 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TNP2Q05952 138 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 XP32Q5T750 250 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 CEP135Q66GS9 1140 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 UBR7Q8N806 425 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 CDC6Q99741 560 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RUSC1Q9BVN2 902 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.54□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 FAM187AA6NFU0 413 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 J3QW42 95 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TNFRSF10AO00220 468 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TSPAN6O43657 245 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ADCY3O60266 1144 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 GDF9O60383 454 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 HTR3BO95264 441 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RASGRP1O95267 797 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 PTPRAP18433 802 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 L1CAMP32004 1257 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 GUCY2FP51841 1108 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 RNF180Q86T96 592 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 STK35Q8TDR2 534 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 DHRS4Q9BTZ2 278 aa4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
MED28P6-201ENST00000558776 STRN4Q9NRL3 753 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms