RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
LGMN-216ENST00000557434 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
LGMN-216ENST00000557434 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.64■□□□□ 0.9
LGMN-216ENST00000557434 ZNF213O14771 459 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 USP5P45974 858 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 RABEP1Q15276 862 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 DPF2Q92785 391 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SIPA1L1O43166 1804 aa20.64■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 PPARAQ07869 468 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 GPC2Q8N158 579 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 OGFOD1Q8N543 542 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.63■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 GRIN3BO60391 1043 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SBK1Q52WX2 424 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MICALL2Q8IY33 904 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 TTC14Q96N46 770 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 NEDD4P46934 1319 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 WNT10BO00744 389 aa20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 PLCD1P51178 756 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 PICALMQ13492 652 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 C12orf60Q5U649 245 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 IDI2Q9BXS1 227 aa20.61■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 NEK4P51957 841 aa20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 DLGAP5Q15398 846 aa20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 RUFY3Q7L099 469 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 NEK1Q96PY6 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 CLRN2A0PK11 232 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 FGRP09769 529 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 KRT32Q14532 448 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 EPS15P42566 896 aa20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
LGMN-216ENST00000557434 RPS6KB1P23443 525 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 ANTXR2P58335 489 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 TCP10Q12799 353 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 SNX21Q969T3 373 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 CNTNAP1P78357 1384 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 SLURP2P0DP57 97 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 MMP14P50281 582 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.57■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 B4E1Z4 1266 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 PSMA5P28066 241 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 CHST3Q7LGC8 479 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.56■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.55■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 PRDM1O75626 825 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 AK2P54819 239 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 GABPAQ06546 454 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 NCOA7Q8NI08 942 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LGMN-216ENST00000557434 SLC4A3P48751 1232 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms