RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553944.2

ACTN1-AS1-201, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 484 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP40Q9NVE5 1235 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FOCADQ5VW36 1801 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.04□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 H7C1D1 291 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYO1BO43795 1136 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RHBDL3P58872 404 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TRDNQ13061 729 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RASEFQ8IZ41 740 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEK1Q96PY6 1258 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PALD1Q9ULE6 856 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAMA4Q16363 1823 aa10.03□□□□□ -0.8
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYH1P12882 1939 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MINDY4BA8MYZ0 360 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP17L12C9JPN9 530 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 USP17L21D6R901 530 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 E7EWF7 191 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ST18O60284 1047 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NT5C2P49902 561 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PPARAQ07869 468 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CTR9Q6PD62 1173 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NCOA7Q8NI08 942 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IDI2Q9BXS1 227 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.02□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPDYE6P0CI01 402 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCM2P49736 904 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 NEK4P51957 841 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HAND2P61296 217 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BECN1Q14457 450 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 AKNAD1Q5T1N1 836 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 C12orf60Q5U649 245 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RUFY3Q7L099 469 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TTC6Q86TZ1 520 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SNX21Q969T3 373 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 KRT23Q9C075 422 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FLT1P17948 1338 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 IQCA1LA6NCM1 817 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ENTPD3O75355 529 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PDE4BQ07343 736 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ADCK5Q3MIX3 580 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MICALL2Q8IY33 904 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 STAG1Q8WVM7 1258 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 LAMB1P07942 1786 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 POTECB2RU33 542 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 WNT10BO00744 389 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HLA-DOAP06340 250 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 FGRP09769 529 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 RPS6KB1P23443 525 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 MCM5P33992 734 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 TNNI2P48788 182 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 HTRA3P83110 453 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 PICALMQ13492 652 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 ANKRD1Q15327 319 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-AS1-201ENST00000553944 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms