RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 SNX17Q15036 470 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 PKN1Q16512 942 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 DACH1Q9UI36 760 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 AOX1Q06278 1338 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 DNM1LO00429 736 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 PPP2R1AP30153 589 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 GTF2IP78347 998 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TRIM60Q495X7 471 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RALBP1Q15311 655 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RASIP1Q5U651 963 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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CS-225ENST00000551253 TRANK1O15050 2925 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 GAKO14976 1311 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 PRR23AA6NEV1 266 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CXCL11O14625 94 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RAG1P15918 1043 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CYP2B6P20813 491 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TNNI2P48788 182 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 LPAR1Q92633 364 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CFAP53Q96M91 514 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RLFQ13129 1914 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 PLXNA3P51805 1871 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CACNA1HO95180 2353 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 KIAA0355O15063 1070 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CERS5Q8N5B7 392 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 COL4A6Q14031 1691 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 F8W031 263 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CLTBP09497 229 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TLE2Q04725 743 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RMDN1Q96DB5 314 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 HOOK2Q96ED9 719 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 FAM89AQ96GI7 184 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 AK9Q5TCS8 1911 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 MSCO60682 206 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 PRKAR2BP31323 418 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 TMEM240Q5SV17 173 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 CCDC174Q6PII3 467 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 TXNRD3Q86VQ6 643 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 NUDCQ9Y266 331 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 SLC5A1P13866 664 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 INPP5BP32019 993 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-225ENST00000551253 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.2□□□□□ -0.94
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CS-225ENST00000551253 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.19□□□□□ -0.94
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CS-225ENST00000551253 RFXAPO00287 272 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 IL9P15248 144 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-225ENST00000551253 DSG3P32926 999 aa9.19□□□□□ -0.94
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