RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 PICALMQ13492 652 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 CSADQ9Y600 493 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.66■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 INPP5BP32019 993 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-219ENST00000550655 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 INHBEP58166 350 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 IFNL1Q8IU54 200 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PTPRFP10586 1907 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 MYH1P12882 1939 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PPP4CP60510 307 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 TEX11Q8IYF3 940 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 OTUD5Q96G74 571 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 CRBNQ96SW2 442 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 DCTPP1Q9H773 170 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 TBC1D8O95759 1140 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 SLURP2P0DP57 97 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 MAP3K10Q02779 954 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 ERO1BQ86YB8 467 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 BCL11AQ9H165 835 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 BAG3O95817 575 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PTPN18Q99952 460 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 ALDH1A1P00352 501 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PLCG2P16885 1265 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 CYP7A1P22680 504 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 PPIL2Q13356 520 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 ATP5JP18859 108 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 MAP3K12Q12852 859 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 FLT1P17948 1338 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 GOLIM4O00461 696 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 IRF6O14896 467 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 GTF2A2P52657 109 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CS-219ENST00000550655 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 GPR25O00155 361 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 TBC1D12O60347 775 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 PPATQ06203 517 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 CCL15Q16663 113 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 FAM196BA6NMK8 535 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 PDE6AP16499 860 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 HAUS7Q99871 368 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 CETPP11597 493 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 CRHR2Q13324 411 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 SNAPC2Q13487 334 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 CERS3Q8IU89 383 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 DGKZQ13574 1117 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-219ENST00000550655 ABHD8Q96I13 439 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms