RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ITGAEP38570 1179 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 MRS2Q9HD23 443 aa8.26□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 SLFN14P0C7P3 912 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 CYP27A1Q02318 531 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ABI1Q8IZP0 508 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 PIDD1Q9HB75 910 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.25□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS2O15393 492 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.24□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ZNF862O60290 1169 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 RECKO95980 971 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 PRNPP04156 253 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ID3Q02535 119 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 KCNB2Q92953 911 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.23□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 CTSHP09668 335 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 FBXL18Q96ME1 805 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 BACH2Q9BYV9 841 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 RNF114Q9Y508 228 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.22□□□□□ -1.09
TRDN-204ENST00000542443 GSTT1P30711 240 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 TXKP42681 527 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 CDK5R2Q13319 367 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 FLCNQ8NFG4 579 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 CRELD1Q96HD1 420 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.21□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 USP17L7P0C7H9 530 aa8.2□□□□□ -1.1
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TRDN-204ENST00000542443 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.2□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 SULF2Q8IWU5 870 aa8.2□□□□□ -1.1
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TRDN-204ENST00000542443 PDZD3Q86UT5 571 aa8.19□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 STK35Q8TDR2 534 aa8.19□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.19□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.19□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 FAM87AP0C7U9 286 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 LCE3BQ5TA77 95 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 CBX8Q9HC52 389 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 USP31Q70CQ4 1352 aa8.18□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 ARNTP27540 789 aa8.17□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.17□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.17□□□□□ -1.1
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TRDN-204ENST00000542443 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 NME2P22392 152 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.15□□□□□ -1.1
TRDN-204ENST00000542443 TCF3P15923 654 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
TRDN-204ENST00000542443 FBXO24O75426 580 aa8.13□□□□□ -1.11
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