RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539982.5

CLSTN3-209, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-209ENST00000539982 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 PICK1Q9NRD5 415 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.58□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 BMP8BP34820 402 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 GPR153Q6NV75 609 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 GADL1Q6ZQY3 521 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 LPIN2Q92539 896 aa14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 SLC5A1P13866 664 aa14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 PRDX5P30044 214 aa14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 MAP3K10Q02779 954 aa14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 GDF15Q99988 308 aa14.56□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 EYA2O00167 538 aa14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ENTPD3O75355 529 aa14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 COA7Q96BR5 231 aa14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 IDI2Q9BXS1 227 aa14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.55□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 LAMA3Q16787 3333 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 RGS3P49796 1198 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 USP44Q9H0E7 712 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.54□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.53□□□□□ -0.08
CLSTN3-209ENST00000539982 TRIM75PA6NK02 468 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SEMA3EO15041 775 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DEFB123Q8N688 67 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.52□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 NBPF3Q9H094 633 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MRS2Q9HD23 443 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PNMA3Q9UL41 463 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.51□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 GAKO14976 1311 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PTPRCP08575 1304 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 RPTORQ8N122 1335 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ZBTB22O15209 634 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 HMGCRP04035 888 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SLURP2P0DP57 97 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ATP2B3Q16720 1220 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 TREML2Q5T2D2 321 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 FBXO3Q9UK99 471 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 ALPK3Q96L96 1907 aa14.5□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 TBC1D12O60347 775 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 CIAO1O76071 339 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SLF2Q8IX21 1173 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 GJD2Q9UKL4 321 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DOCK2Q92608 1830 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PTPRFP10586 1907 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PHKA1P46020 1223 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SPP2Q13103 211 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 Q7L0L9 218 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 TDHQ8IZJ6 230 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SYN1P17600 705 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 TRIM32Q13049 653 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 PICALMQ13492 652 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 SIL1Q9H173 461 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.47□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 DOCK1Q14185 1865 aa14.46□□□□□ -0.09
CLSTN3-209ENST00000539982 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms