RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA3P22001 575 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 COA1Q9GZY4 146 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 NAPBQ9H115 298 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 ANTXR2P58335 489 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 RESTQ13127 1097 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 DOK7Q18PE1 504 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC6Q86TZ1 520 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL34Q8N239 644 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA32Q96LK8 384 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 INCENPQ9NQS7 918 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN9AQ15858 1988 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 DPEP1P16444 411 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2IP78347 998 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-211ENST00000539589 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM22K7EJ46 135 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TDO2P48775 406 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 IGSF3O75054 1194 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP45Q9UL16 551 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 NEDD4P46934 1319 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 C21orf2O43822 256 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 EYA3Q99504 573 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 MTFR1LQ9H019 292 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CERS5Q8N5B7 392 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL6Q8N841 843 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM87BQ96K49 555 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 MXD3Q9BW11 206 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CPLX1O14810 134 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 B4E1Z4 1266 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 GSTO1P78417 241 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 PPARAQ07869 468 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMB1P07942 1786 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 FOSBP53539 338 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP4CP60510 307 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 EVX2Q03828 476 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 ATL3Q6DD88 541 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF214Q8ND24 703 aa23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXW7Q969H0 707 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 CTR9Q6PD62 1173 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT23Q9C075 422 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIA3O75145 1194 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 LDHCP07864 332 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 AOC3Q16853 763 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PODNQ7Z5L7 613 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 POLD1P28340 1107 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-211ENST00000539589 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.62■■□□□ 1.37
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