RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 GMLQ99445 158 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L12C9JPN9 530 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L21D6R901 530 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L8P0C7I0 530 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CRKP46108 304 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CHST3Q7LGC8 479 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 TMX3Q96JJ7 454 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 MRIQ9BWK5 157 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2D6P10635 497 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 YY1P25490 414 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 PPARAQ07869 468 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 H7C1D1 291 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-209ENST00000532457 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 TEKT1Q969V4 418 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 NEDD4P46934 1319 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 USP5P45974 858 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MCM2P49736 904 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 TEX11Q8IYF3 940 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 IL27Q8NEV9 243 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ANTXR2P58335 489 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MICALL2Q8IY33 904 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 HACL1Q9UJ83 578 aa26■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR90Q96KV7 1748 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 LARGE1O95461 756 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 Q6ZUG5 572 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 NCOA7Q8NI08 942 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 USP40Q9NVE5 1235 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SBK1Q52WX2 424 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SCN4AP35499 1836 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 B4E1Z4 1266 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 PLCG2P16885 1265 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 CERS3Q8IU89 383 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 EPS15P42566 896 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 C12orf60Q5U649 245 aa25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 RRAGCQ9HB90 399 aa25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-209ENST00000532457 FLT1P17948 1338 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 PRC1O43663 620 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 PLCD1P51178 756 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 CUL4AQ13619 759 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 ME3Q16798 604 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 FGRP09769 529 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 MCM5P33992 734 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 EPHX2P34913 555 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 CFAP100Q494V2 611 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 TRDNQ13061 729 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-209ENST00000532457 BRF1Q92994 677 aa25.93■■□□□ 1.74
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