RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 PLCD1P51178 756 aa18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.44■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.42■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 TOMM22Q9NS69 142 aa18.42■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TRPS1-206ENST00000517323 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.41■□□□□ 0.54
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TRPS1-206ENST00000517323 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 PRC1O43663 620 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 PPFIA3O75145 1194 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 STK3Q13188 491 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.35■□□□□ 0.53
TRPS1-206ENST00000517323 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.35■□□□□ 0.53
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