RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRASLS5Q96KN8 279 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf173Q96LM9 149 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CORO1BQ9BR76 489 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 JAG2Q9Y219 1238 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa2.58□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCSK2P16519 638 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ID3Q02535 119 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNMB1Q16558 191 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC38A3Q99624 504 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MKNK2Q9HBH9 465 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM53CQ9NYF3 392 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa2.57□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM265A0A087WTH1 108 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARNS1A5YM72 827 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM88BA6NKF7 163 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHA2P01877 340 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INHBBP09529 407 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSFA2P28290 1259 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZP2Q05996 745 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ORC1Q13415 861 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IKZF1Q13422 519 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIAH1Q8IUQ4 282 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOX2Q96NM4 488 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPHS2Q9NP85 383 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD320Q9NPF0 282 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANO2Q9NQ90 1003 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa2.56□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR33A8MZF0 331 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EOMESO95936 686 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLI1P08151 1106 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP3B2Q13367 1082 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMIGO3Q86WK7 504 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PBXIP1Q96AQ6 731 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATXN3LQ9H3M9 355 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIDD1Q9HB75 910 aa2.55□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXA5P20719 270 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EHHADHQ08426 723 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALKBH2Q6NS38 261 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC16Q8NEE8 873 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DIRC2Q96SL1 478 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EHD4Q9H223 541 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP13A1Q9HD20 1204 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA3GQ9NS98 782 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNX11Q9Y5W9 270 aa2.54□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP5P45974 858 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRM2Q14416 872 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASIP1Q5U651 963 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PI16Q6UXB8 463 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKLE2Q86XL3 938 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIRREL1Q96J84 757 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R16BQ96T49 567 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM10Q9NQV6 1147 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT82Q9NSB4 513 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa2.53□□□□□ -2
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR182O15218 404 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM13AO94988 1023 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED14OSP0DP75 135 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTSWP56202 376 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVFC1P60507 584 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP4P98171 946 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RING1Q06587 406 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AAMPQ13685 434 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNA10Q16322 511 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPM1JQ5JR12 505 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATG14Q6ZNE5 492 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYFIP1Q7L576 1253 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF214Q8ND24 703 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPBAR1Q8TDU6 330 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASB11Q8WXH4 323 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SP110Q9HB58 689 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSADQ9Y600 493 aa2.52□□□□□ -2.01
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLITRK5O94991 958 aa2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms