RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FSIP1	Q8NA03	581 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX11	Q96FC9	970 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	USP28	Q96RU2	1077 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LTN1	O94822	1766 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD21	O60216	631 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM193A	P78312	1265 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NR6A1	Q15406	480 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN14	Q15678	1187 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	RGS22	Q8NE09	1264 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SIL1	Q9H173	461 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR108	Q9NPR9	543 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WWV3	80 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GC	P02774	474 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBB4A	P04350	444 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GLI3	P10071	1580 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CTH	P32929	405 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	APOBR	Q0VD83	1088 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NCAPH	Q15003	741 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TERF2	Q15554	542 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT222	Q8N1A0	295 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JLW4	131 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		E7EWF7	191 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXP2	O15409	715 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	YEATS4	O95619	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	GGCX	P38435	758 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFA8	P51970	172 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRP12	P59046	1061 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXO4	P98177	505 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNH2	Q12809	1159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ELF2	Q15723	593 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAL	Q6DHV7	355 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF790	Q6PG37	636 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.77	□□□□□ -1.49

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