RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 GNA15P30679 374 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SPEM2Q0P670 501 aa9.68□□□□□ -0.86
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HERC3-210ENST00000512194 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PNMA5Q96PV4 448 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SETDB2Q96T68 719 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CHRDQ9H2X0 955 aa9.68□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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HERC3-210ENST00000512194 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PSMD2Q13200 908 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SV2AQ7L0J3 742 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 MRS2Q9HD23 443 aa9.67□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CNTN3Q9P232 1028 aa9.67□□□□□ -0.86
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HERC3-210ENST00000512194 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CEP350Q5VT06 3117 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 GIPC1O14908 333 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 SORBS3O60504 671 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 MAP3K6O95382 1288 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 RARAP10276 462 aa9.66□□□□□ -0.86
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HERC3-210ENST00000512194 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 OR13H1Q8NG92 308 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 COG3Q96JB2 828 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.66□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CD33P20138 364 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 CES1P23141 567 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.65□□□□□ -0.86
HERC3-210ENST00000512194 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.65□□□□□ -0.86
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HERC3-210ENST00000512194 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.64□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 EREGO14944 169 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 FYB1O15117 783 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 MMP20O60882 483 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 APBA3O96018 575 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 NFKB1P19838 968 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 SOX18P35713 384 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 SLC30A3Q99726 388 aa9.64□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 ZFATQ9P243 1243 aa9.64□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 USP6P35125 1406 aa9.64□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 RECKO95980 971 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 PSAPP07602 524 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 VEGFBP49765 207 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 FAM161BQ96MY7 647 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 RNF19AQ9NV58 838 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.63□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 KCNQ2O43526 872 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 EDN3P14138 238 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 PPP2R1AP30153 589 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 GRIN2CQ14957 1233 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.62□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 BACH2Q9BYV9 841 aa9.62□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 KIAA0232Q92628 1395 aa9.62□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 PLAURQ03405 335 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 CHRNA2Q15822 529 aa9.61□□□□□ -0.87
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HERC3-210ENST00000512194 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.61□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 SSH2Q76I76 1423 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 GPR25O00155 361 aa9.6□□□□□ -0.87
HERC3-210ENST00000512194 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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