RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TMCO1Q9UM00 188 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MAP2K7O14733 419 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TUBA1BP68363 451 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 MAP7Q14244 749 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC93Q567U6 631 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TUBA1AQ71U36 451 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 INSRP06213 1382 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D12O60347 775 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 GFPT2O94808 682 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R5BQ15173 497 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DDB1Q16531 1140 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 KANK3Q6NY19 840 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TTC39CQ8N584 583 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-216ENST00000507116 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFAB1O14561 156 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 MGEA5O60502 916 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 HIP1RO75146 1068 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PRKAR2BP31323 418 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 HOXD12P35452 270 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 USH1GQ495M9 461 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 TEKT4Q8WW24 435 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC45Q96CN5 670 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 MUC3BQ9H195 1237 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 TOPBP1Q92547 1522 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 TTI1O43156 1089 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 B3GALNT1O75752 331 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 RASSF9O75901 435 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC166P0CW27 439 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CCT5P48643 541 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CTAG1AP78358 180 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SCYL1Q96KG9 808 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CENPHQ9H3R5 247 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 KCND1Q9NSA2 647 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 RGL2O15211 777 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PDGFRBP09619 1106 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SYT1P21579 422 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 AMPHP49418 695 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 BIRC3Q13489 604 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 KAZNQ674X7 775 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 OPTNQ96CV9 577 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 EPSTI1Q96J88 318 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 PIK3R4Q99570 1358 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1B0GVG6 124 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SGTAO43765 313 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 AKR1B10O60218 316 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 CNGA1P29973 690 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 GNAQP50148 359 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 LRMPQ12912 555 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 IQCEQ6IPM2 695 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 LUZP1Q86V48 1076 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-216ENST00000507116 DRC7Q8IY82 874 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms