RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505552.1

ITGA3-205, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-205ENST00000505552 POTEHQ6S545 545 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.73□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 TMX3Q96JJ7 454 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 SYT17Q9BSW7 474 aa6.73□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.73□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 USP17L8P0C7I0 530 aa6.72□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.72□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.72□□□□□ -1.33
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ITGA3-205ENST00000505552 USP17L12C9JPN9 530 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 USP17L21D6R901 530 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 ZNF213O14771 459 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 CHST3Q7LGC8 479 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 IDI2Q9BXS1 227 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 BCS1LQ9Y276 419 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 CNTNAP1P78357 1384 aa6.7□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.7□□□□□ -1.34
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ITGA3-205ENST00000505552 SLF2Q8IX21 1173 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 NCOA7Q8NI08 942 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-205ENST00000505552 NACAP1Q9BZK3 213 aa6.7□□□□□ -1.34
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