RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NELFCD-210ENST00000490205 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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NELFCD-210ENST00000490205 ERVK-24P63145 666 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 MISP3Q96FF7 219 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 CEP44Q9C0F1 390 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 SAMM50Q9Y512 469 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 RNF214Q8ND24 703 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 NETO1Q8TDF5 533 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 GIPC1O14908 333 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 NEFMP07197 916 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.351e-10■□□□□ 8.4
NELFCD-210ENST00000490205 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 COL19A1Q14993 1142 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ISL2Q96A47 359 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ASIC4Q96FT7 647 aa6.62□□□□□ -1.35
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NELFCD-210ENST00000490205 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 LEFTY1O75610 366 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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NELFCD-210ENST00000490205 KCNA1Q09470 495 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NELFCD-210ENST00000490205 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.61□□□□□ -1.35
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NELFCD-210ENST00000490205 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 PPM1JQ5JR12 505 aa6.58□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.58□□□□□ -1.36
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NELFCD-210ENST00000490205 C12orf49Q9H741 205 aa6.57□□□□□ -1.36
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NELFCD-210ENST00000490205 FRMD6Q96NE9 622 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFCD-210ENST00000490205 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
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