RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ADD2P35612 726 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 PDE1AP54750 535 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 GRM1Q13255 1194 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 CERS3Q8IU89 383 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 HOOK2Q96ED9 719 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 MYH1P12882 1939 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 JMYQ8N9B5 988 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 SIPA1L1O43166 1804 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 DCAF15Q66K64 600 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 FLT1P17948 1338 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRN-216ENST00000486480 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 NEFLP07196 543 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 SLC10A3P09131 477 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 UBE3CQ15386 1083 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CSRNP1Q96S65 589 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 LAMB1P07942 1786 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CHGBP05060 677 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CCDC102AQ96A19 550 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 UNCXA6NJT0 531 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 AOC2O75106 756 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 NOGQ13253 232 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 LCORLQ8N3X6 602 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 MBD4O95243 580 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 USP5P45974 858 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 WRNIP1Q96S55 665 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 FSD1Q9BTV5 496 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ARMT1Q9H993 441 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 DOCK1Q14185 1865 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 PDE4AP27815 886 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 MAP2K2P36507 400 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K9P80192 1104 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 VGLL4Q14135 290 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 APPBP2Q92624 585 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 EVI5LQ96CN4 794 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ZIC5Q96T25 663 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 CSADQ9Y600 493 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRN-216ENST00000486480 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 MAP3K10Q02779 954 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SLURP2P0DP57 97 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 AIDAQ96BJ3 306 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 WNK4Q96J92 1243 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 ELP3Q9H9T3 547 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 PALD1Q9ULE6 856 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 FAM196BA6NMK8 535 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D12O60347 775 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 INPP5BP32019 993 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SPRYD7Q5W111 196 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 OSBP2Q969R2 916 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 PRKAB2O43741 272 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRN-216ENST00000486480 HLA-DOAP06340 250 aa23.03■■□□□ 1.28
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