RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ITGA6P23229 1130 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 FANCLQ9NW38 375 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 SPTLC2O15270 562 aa18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 STARD3NLO95772 234 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf76Q96K31 380 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
CCSAP-204ENST00000483092 CTDNEP1O95476 244 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HDXQ7Z353 690 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 INCENPQ9NQS7 918 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 FGAP02671 866 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS2O95450 1211 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 LIG3P49916 1009 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL34Q8N239 644 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CNNM3Q8NE01 707 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SPECC1Q5M775 1068 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ATG3Q9NT62 314 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TXLNAP40222 546 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SYKP43405 635 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PNOCQ13519 176 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ALS2Q96Q42 1657 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 H0YHG0 523 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP12P59046 1061 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RABGGTAQ92696 567 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB6Q9NP58 842 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SH3TC1Q8TE82 1336 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 FANCGO15287 622 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP6O43182 974 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB4AP04350 444 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PRC1O43663 620 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA9P43362 315 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 MYL5Q02045 173 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 MTF1Q14872 753 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PPM1EQ8WY54 764 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 GPAA1O43292 621 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 KIF5CO60282 957 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ENGASEQ8NFI3 743 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RAI14Q9P0K7 980 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 KIF1AQ12756 1690 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ATP8B1O43520 1251 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 LONRF3Q496Y0 759 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PFKFB2O60825 505 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ADALQ6DHV7 355 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF213O14771 459 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 MCAMP43121 646 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PPARDQ03181 441 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 MYL10Q9BUA6 226 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF827Q17R98 1081 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CPDO75976 1380 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PFKFB1P16118 471 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 AIFM3Q96NN9 605 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC151A5D8V7 595 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 PHKA1P46020 1223 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CCSAP-204ENST00000483092 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms