RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482814.5

GCOM1-208, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 2

Gene GCOM1, Length 1,620 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-208ENST00000482814 FAM83AQ86UY5 434 aa21.87■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 KCNB2Q92953 911 aa21.87■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.87■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.87■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 WDR90Q96KV7 1748 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.86■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 EPHX2P34913 555 aa21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 CTR9Q6PD62 1173 aa21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 SCN4AP35499 1836 aa21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 USP17L12C9JPN9 530 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 USP17L21D6R901 530 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 SLC27A2O14975 620 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 EGFRP00533 1210 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 PICALMQ13492 652 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 KRT32Q14532 448 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 TTC6Q86TZ1 520 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 CLRN2A0PK11 232 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 NFIAQ12857 509 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 FAM151AQ8WW52 585 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 IL17RAQ96F46 866 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.84■■□□□ 1.09
GCOM1-208ENST00000482814 CYP21A2P08686 494 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 NT5C2P49902 561 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 IL27Q8NEV9 243 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 VEZTQ9HBM0 779 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 FOCADQ5VW36 1801 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.83■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 HLA-DOAP06340 250 aa21.82■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PPARAQ07869 468 aa21.82■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 C12orf60Q5U649 245 aa21.82■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 CACNB3P54284 484 aa21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.81■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 POTECB2RU33 542 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PSMA5P28066 241 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 EHD4Q9H223 541 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PALD1Q9ULE6 856 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.8■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 TCP10Q12799 353 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 GGA3Q9NZ52 723 aa21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 HAND2P61296 217 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 PDE4BQ07343 736 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 TRDNQ13061 729 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 RASEFQ8IZ41 740 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 CNTNAP1P78357 1384 aa21.78■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 FGRP09769 529 aa21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 RASA3Q14644 834 aa21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 HOOK2Q96ED9 719 aa21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 SWAP70Q9UH65 585 aa21.77■■□□□ 1.08
GCOM1-208ENST00000482814 E7EWF7 191 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 PLCD1P51178 756 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 KRT23Q9C075 422 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 RRAGCQ9HB90 399 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.77■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 NCOA7Q8NI08 942 aa21.76■■□□□ 1.07
GCOM1-208ENST00000482814 MYH1P12882 1939 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms