RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 LAMB1P07942 1786 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 LDHCP07864 332 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 SLURP2P0DP57 97 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 PPIL2Q13356 520 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 PPATQ06203 517 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 CETPP11597 493 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 SNAPC2Q13487 334 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ZAP70P43403 619 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 BTBD19C9JJ37 291 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 RGS19P49795 217 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 TRIM17Q9Y577 477 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-211ENST00000482015 SOX10P56693 466 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 SP3Q02447 781 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.01■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 AK9Q5TCS8 1911 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 CAP1Q01518 475 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 MAP3K10Q02779 954 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 OTOP1Q7RTM1 612 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 AACSQ86V21 672 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 ERO1AQ96HE7 468 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 TEX11Q8IYF3 940 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 APBB1O00213 710 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 FAM196BA6NMK8 535 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 PICK1Q9NRD5 415 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 BAG3O95817 575 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 PTPRAP18433 802 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 MOGSQ13724 837 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 BCL11AQ9H165 835 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 EFCC1Q9HA90 598 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D12O60347 775 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 TLR2O60603 784 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 HMMRO75330 724 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 PPP4CP60510 307 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 DOCK2Q92608 1830 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 PDHXO00330 501 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CXCL11O14625 94 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.94■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 PLCG2P16885 1265 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CYP7A1P22680 504 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 PDE3AQ14432 1141 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.93■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.92■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 IGSF3O75054 1194 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 CPA4Q9UI42 421 aa22.91■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 FLT1P17948 1338 aa22.9■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
UPP1-211ENST00000482015 TRIM75PA6NK02 468 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms