RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478378.5

TIMM17A-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17A, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-202ENST00000478378 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.49□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 CDH23Q9H251 3354 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 CXCL11O14625 94 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 GABBR2O75899 941 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 BCAMP50895 628 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 COA7Q96BR5 231 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF112Q9UJU3 913 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.48□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 GRM8O00222 908 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 SYN1P17600 705 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 TCP10Q12799 353 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM151AQ8WW52 585 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 MRIQ9BWK5 157 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 PICK1Q9NRD5 415 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 RPTORQ8N122 1335 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 MUC3AQ02505 3323 aa8.47□□□□□ -1.05
TIMM17A-202ENST00000478378 LTBP2Q14767 1821 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 F6X3S4 739 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 HMGCRP04035 888 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 METTL24Q5JXM2 366 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 BEND3Q5T5X7 828 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 NBPF3Q9H094 633 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 MYO9BQ13459 2157 aa8.46□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PNMA3Q9UL41 463 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 KIF16BQ96L93 1317 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.45□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 TRIM75PA6NK02 468 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PTPRAP18433 802 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 NFIAQ12857 509 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC27Q2M243 656 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 IL16Q14005 1332 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.44□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ALDH1L1O75891 902 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PDE8BO95263 885 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 LRRC24Q50LG9 513 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 WWC1Q8IX03 1113 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 SUCLG2Q96I99 432 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 GUCD1Q96NT3 240 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PFASO15067 1338 aa8.43□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC5A1P13866 664 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 RGS3P49796 1198 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 USP40Q9NVE5 1235 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 RLFQ13129 1914 aa8.42□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 ENTPD3O75355 529 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 VAMP4O75379 141 aa8.41□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
TIMM17A-202ENST00000478378 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms