RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, human

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH4-208	ENST00000477413	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	HTT	P42858	3142 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	OTUD5	Q96G74	571 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	PPAT	Q06203	517 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	FKTN	O75072	461 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	HMMR	O75330	724 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	INPP5B	P32019	993 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.73	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.72	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	IRF6	O14896	467 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	CRHR2	Q13324	411 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	CCL15	Q16663	113 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	PTPRF	P10586	1907 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CNIH4-208	ENST00000477413	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	CETP	P11597	493 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	TBC1D12	O60347	775 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	ZAP70	P43403	619 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	PPP4C	P60510	307 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	PLCG2	P16885	1265 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	RGS19	P49795	217 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	AACS	Q86V21	672 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	PICALM	Q13492	652 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		27.66	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	BAG3	O95817	575 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.65	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CNIH4-208	ENST00000477413	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	MOGS	Q13724	837 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	CXCL11	O14625	94 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.62	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	PTPRA	P18433	802 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	SP3	Q02447	781 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	FLT1	P17948	1338 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	TLR2	O60603	784 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	PICK1	Q9NRD5	415 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CNIH4-208	ENST00000477413	MYH1	P12882	1939 aa		27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.57	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.56	■■■□□ 2
CNIH4-208	ENST00000477413	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.56	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 633.5 ms