RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476930.1

PTPRN-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, human

TSL 3

Gene PTPRN, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRN-213	ENST00000476930	CCL15	Q16663	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	MYH1	P12882	1939 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	IRF6	O14896	467 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	ENTPD3	O75355	529 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	MS4A1	P11836	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	GTF2A2	P52657	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	PICALM	Q13492	652 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRN-213	ENST00000476930	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PPIL2	Q13356	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	LDHC	P07864	332 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ZAP70	P43403	619 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	GSTO1	P78417	241 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	CAP1	Q01518	475 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PPAT	Q06203	517 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	CETP	P11597	493 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	MGAM	O43451	1857 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	MYH7	P12883	1935 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	APBB1	O00213	710 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	RGS19	P49795	217 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	AACS	Q86V21	672 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SOX10	P56693	466 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SP3	Q02447	781 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	MOGS	Q13724	837 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	TEX11	Q8IYF3	940 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRN-213	ENST00000476930	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	TBC1D12	O60347	775 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	PTPRA	P18433	802 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	PPP4C	P60510	307 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	PDHX	O00330	501 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	TLR2	O60603	784 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	HMMR	O75330	724 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	BAG3	O95817	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRN-213	ENST00000476930	CYP7A1	P22680	504 aa		13.63	□□□□□ -0.23

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