RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	LAMB1	P07942	1786 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ERO1B	Q86YB8	467 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	GPR25	O00155	361 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	RAB11FIP3	O75154	756 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	PTPN18	Q99952	460 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	GTF2A2	P52657	109 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	CCL15	Q16663	113 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	TEX11	Q8IYF3	940 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
MIB2-208	ENST00000473511	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	IRF6	O14896	467 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	BAG3	O95817	575 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	PPIL2	Q13356	520 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	CRHR2	Q13324	411 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	FKTN	O75072	461 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	PLCG2	P16885	1265 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	CYP7A1	P22680	504 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	PPAT	Q06203	517 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	SNAPC2	Q13487	334 aa		27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	CETP	P11597	493 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	PPP4C	P60510	307 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	IGSF3	O75054	1194 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	MAP3K12	Q12852	859 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	PICK1	Q9NRD5	415 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	FLT1	P17948	1338 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	GOLIM4	O00461	696 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		27.72	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		27.71	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	TBC1D12	O60347	775 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	PTPRA	P18433	802 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.03
MIB2-208	ENST00000473511	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.69	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	DCTPP1	Q9H773	170 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PALD1	Q9ULE6	856 aa		27.68	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	PDE6A	P16499	860 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	ATP5J	P18859	108 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		27.67	■■■□□ 2.02
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02

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