RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471438.2

CSMD2-208, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 2, human

TSL 5

Gene CSMD2, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD2-208	ENST00000471438	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MYO19	Q96H55	970 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	KIF14	Q15058	1648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438		E9PCH4	1651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ABCC5	O15440	1437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	DAPK1	P53355	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	USP11	P51784	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	HYAL2	Q12891	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	OCLN	Q16625	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	WNT8B	Q93098	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PZP	P20742	1482 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CSMD2-208	ENST00000471438	PTPRA	P18433	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CABP4	P57796	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ECM1	Q16610	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	INSR	P06213	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	LAMC1	P11047	1609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438		H3BRJ5	948 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PRMT3	O60678	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ATG7	O95352	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TSPAN15	O95858	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	COX20	Q5RI15	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CSRNP1	Q96S65	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	AFF2	P51816	1311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	NPAT	Q14207	1427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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