RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF862	O60290	1169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	GLI1	P08151	1106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	NFIB	O00712	420 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	NEFM	P07197	916 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNA10	Q16322	511 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	B3GALT4	O96024	378 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGIP1-208	ENST00000468570	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	AFM	P43652	599 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ID3	Q02535	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	FZD6	O60353	706 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	NFKB2	Q00653	900 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ISL2	Q96A47	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ATG7	O95352	703 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	EHD4	Q9H223	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	GLDC	P23378	1020 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	NUAK1	O60285	661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	LINC00310	P59036	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ERVFC1	P60507	584 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ORC1	Q13415	861 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	GJD3	Q8N144	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNB2	Q92953	911 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570		H3BS24	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SGIP1-208	ENST00000468570	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	ABL1	P00519	1130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	BMP7	P18075	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	ITPKA	P23677	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	GDNF	P39905	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	PPM1J	Q5JR12	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SGIP1-208	ENST00000468570	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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