RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468234.1

SERINC3-204, Transcript of serine incorporator 3, human

TSL 2

Gene SERINC3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERINC3-204	ENST00000468234	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	APP	P05067	770 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	RASA3	Q14644	834 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SERINC3-204	ENST00000468234	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	FLT1	P17948	1338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PRKAB2	O43741	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	REC8	O95072	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	CACNB3	P54284	484 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	TCP10	Q12799	353 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	NFIA	Q12857	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PICALM	Q13492	652 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MYH7	P12883	1935 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	NF2	P35240	595 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	TDO2	P48775	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	NAPB	Q9H115	298 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	TBC1D12	O60347	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	FGA	P02671	866 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	POTEJ	P0CG39	1038 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	USP17L21	D6R901	530 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	EHD4	Q9H223	541 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	IL25	Q9H293	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	ZNF213	O14771	459 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	FOXP2	O15409	715 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	NT5C2	P49902	561 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	PTH1R	Q03431	593 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SERINC3-204	ENST00000468234	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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