RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM37	O94972	964 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	MED26	O95402	600 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	PSMD2	Q13200	908 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	SHISA5	Q8N114	240 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	GATA6	Q92908	595 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	ERVK-24	P63145	666 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	DAB2	P98082	770 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	LGR6	Q9HBX8	967 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	CYP27A1	Q02318	531 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM6-215	ENST00000466247	FOSL1	P15407	271 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	SPINK2	P20155	84 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	TMC4	Q7Z404	712 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	NEFM	P07197	916 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	ISL2	Q96A47	359 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CYP26A1	O43174	497 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	DTX1	Q86Y01	620 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	LMNB1	P20700	586 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	ITGAE	P38570	1179 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	SORBS3	O60504	671 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	FANCG	O15287	622 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CTSH	P09668	335 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	RLBP1	P12271	317 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	LIG3	P49916	1009 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	RING1	Q06587	406 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	CRELD1	Q96HD1	420 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM6-215	ENST00000466247	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	WNT11	O96014	354 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	NTF4	P34130	210 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	HDX	Q7Z353	690 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	INPP5A	Q14642	412 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM6-215	ENST00000466247	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21

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