RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP7A1P22680 504 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TM4SF4P48230 202 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INHBEP58166 350 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPATCH3Q96I76 525 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GOLIM4O00461 696 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AAMPQ13685 434 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CERS3Q8IU89 383 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AK9Q5TCS8 1911 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP5JP18859 108 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP4CP60510 307 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OTUD5Q96G74 571 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ALDH1A1P00352 501 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERO1BQ86YB8 467 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAG1Q9NWQ8 432 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INPP5BP32019 993 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GJA5P36382 358 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GTF2A2P52657 109 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OTOFQ9HC10 1997 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFNL1Q8IU54 200 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HAUS7Q99871 368 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PICK1Q9NRD5 415 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D8O95759 1140 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDE6AP16499 860 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP5P45974 858 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPATQ06203 517 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPIL2Q13356 520 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLT1P17948 1338 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNAPC2Q13487 334 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCL15Q16663 113 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DOCK2Q92608 1830 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D12O60347 775 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CETPP11597 493 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCC1Q96CN9 775 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IRF6O14896 467 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HLA-DOAP06340 250 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAP3K10Q02779 954 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERC2O15083 957 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM196BA6NMK8 535 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PALD1Q9ULE6 856 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms