RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PANK2Q9BZ23 570 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NEDD4P46934 1319 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 MYH6P13533 1939 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF213O14771 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 RIMBP2O15034 1052 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAB2O43741 272 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GNAT2P19087 354 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 HAND2P61296 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2HP62256 183 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GRAPQ13588 217 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NTRK3Q16288 839 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA7Q8NI08 942 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ARMT1Q9H993 441 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LY9Q9HBG7 655 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 SENP2Q9HC62 589 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 SNED1Q8TER0 1413 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PLSCR1O15162 318 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 RFC4P35249 363 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LIFRP42702 1097 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 RCAN1P53805 252 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 STK3Q13188 491 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 SEC23AQ15436 765 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GPR153Q6NV75 609 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 CHST3Q7LGC8 479 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 AIDAQ96BJ3 306 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM87BQ96K49 555 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-210ENST00000462363 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 PSME4Q14997 1843 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM22K7EJ46 135 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CYP7A1P22680 504 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 TXNRD1Q16881 649 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF827Q17R98 1081 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 APOA5Q6Q788 366 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 POTEAQ6S8J7 498 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CNBD1Q8NA66 436 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 PGBD1Q96JS3 809 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RBSNQ9H1K0 784 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 INCENPQ9NQS7 918 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 XDHP47989 1333 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 STK36Q9NRP7 1315 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 B4E1Z4 1266 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 FIBPO43427 364 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 ORC4O43929 436 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 PHF14O94880 888 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM37O94972 964 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINB2P05120 415 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 IL1R1P14778 569 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CDC27P30260 824 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-210ENST00000462363 KRT85P78386 507 aa6.63□□□□□ -1.35
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