RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, human

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	RAB11FIP3	O75154	756 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	ENTPD3	O75355	529 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	29.21	■■■□□ 2.27
SH3BP5-208	ENST00000459627	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	29.2	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	DOCK2	Q92608	1830 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	IFNL1	Q8IU54	200 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	CYP7A1	P22680	504 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	PTPN18	Q99952	460 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM196B	A6NMK8	535 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SH3BP5-208	ENST00000459627	LAMB1	P07942	1786 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	DGKZ	Q13574	1117 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCL15	Q16663	113 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	ERO1B	Q86YB8	467 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	GOLIM4	O00461	696 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	BAG3	O95817	575 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	INHBE	P58166	350 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	GPR25	O00155	361 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	IRF6	O14896	467 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPP4C	P60510	307 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	DCTPP1	Q9H773	170 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	GTF2A2	P52657	109 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	ABHD8	Q96I13	439 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP3K12	Q12852	859 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPIL2	Q13356	520 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SH3BP5-208	ENST00000459627	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	ALDH1A1	P00352	501 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	CRHR2	Q13324	411 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	FLT1	P17948	1338 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PLCG2	P16885	1265 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	MAP3K10	Q02779	954 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PPAT	Q06203	517 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PDE6A	P16499	860 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	ATP5J	P18859	108 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	SNAPC2	Q13487	334 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PALD1	Q9ULE6	856 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	SIPA1L1	O43166	1804 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	CHGB	P05060	677 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	BTBD19	C9JJ37	291 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	FKTN	O75072	461 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	CETP	P11597	493 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	PICK1	Q9NRD5	415 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SH3BP5-208	ENST00000459627	TBC1D12	O60347	775 aa		29.01	■■■□□ 2.23

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