RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 INHBEP58166 350 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PICALMQ13492 652 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DCAF15Q66K64 600 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ENTPD3O75355 529 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MS4A1P11836 297 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CAP1Q01518 475 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CRHR2Q13324 411 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADGRA1Q86SQ6 560 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HTTP42858 3142 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCL15Q16663 113 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC158Q5M9N0 1113 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLF2Q8IX21 1173 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.74■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH1P12882 1939 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IRF6O14896 467 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FKTNO75072 461 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALDH1A1P00352 501 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERO1BQ86YB8 467 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HOOK2Q96ED9 719 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AACSQ86V21 672 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RHPN1Q8TCX5 695 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APBB1O00213 710 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GTF2A2P52657 109 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GSTO1P78417 241 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPIL2Q13356 520 aa17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM196BA6NMK8 535 aa17.71■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANTXR1Q9H6X2 564 aa17.71■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BTBD19C9JJ37 291 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LDHCP07864 332 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP3K10Q02779 954 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MYH7P12883 1935 aa17.7■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPATQ06203 517 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MOGSQ13724 837 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TEX11Q8IYF3 940 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE3AQ14432 1141 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CD99L2Q8TCZ2 262 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KCNH4Q9UQ05 1017 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CETPP11597 493 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNAPC2Q13487 334 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MGAMO43451 1857 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OTOP1Q7RTM1 612 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCL11AQ9H165 835 aa17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CENPFP49454 3210 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HMMRO75330 724 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IDH1O75874 414 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PTPRAP18433 802 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SOX10P56693 466 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP4CP60510 307 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRIM17Q9Y577 477 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FLT1P17948 1338 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYP7A1P22680 504 aa17.64■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa17.64■□□□□ 0.42
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ADGRA2Q96PE1 1338 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SP3Q02447 781 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MAGEB6Q8N7X4 407 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIGA1Q8NAN2 632 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DNAJC18Q9H819 358 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TBC1D12O60347 775 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RGS19P49795 217 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms