RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZFPM1Q8IX07 1006 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SCYL3Q8IZE3 742 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SSH3Q8TE77 659 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM106CQ9BVX2 250 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PICK1Q9NRD5 415 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RFX7Q2KHR2 1363 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.02■□□□□ 0.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MYH2Q9UKX2 1941 aa19.02■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HOXD10P28358 340 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BTDP43251 543 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AK9Q5TCS8 1911 aa19.01■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PDHXO00330 501 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RHBDL3P58872 404 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF333Q96JL9 665 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAP1Q01518 475 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MOGSQ13724 837 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.99■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTPRAP18433 802 aa18.98■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BAG3O95817 575 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PLCG2P16885 1265 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZNF384Q8TF68 577 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RAI14Q9P0K7 980 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ADGRA2Q96PE1 1338 aa18.97■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 POTEFA5A3E0 1075 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MCAMP43121 646 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PPP4CP60510 307 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNNI3KQ59H18 835 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GCC1Q96CN9 775 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SRRDQ9UH36 339 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNNQ9UQP3 1299 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.96■□□□□ 0.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BCRP11274 1271 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MS4A1P11836 297 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAPN2P17655 700 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PICALMQ13492 652 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CERS3Q8IU89 383 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CPA4Q9UI42 421 aa18.95■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PSMC4P43686 418 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PI4KBQ9UBF8 816 aa18.94■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GINM1Q9NU53 330 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DOCK2Q92608 1830 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 FCGRTP55899 365 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PI16Q6UXB8 463 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TRIM47Q96LD4 638 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OSBPP22059 807 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 CAP2P40123 477 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TEX11Q8IYF3 940 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PNMA3Q9UL41 463 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms