RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 SPC24Q8NBT2 197 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 RCAN1P53805 252 aa32.07■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 ADGRA1Q86SQ6 560 aa32.07■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 C8orf37Q96NL8 207 aa32.07■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 MYL10Q9BUA6 226 aa32.07■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 BCL2L12Q9HB09 334 aa32.07■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 IFNAR1P17181 557 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A14Q15043 492 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 TBC1D9BQ66K14 1250 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 TMTC2Q8N394 836 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 TRIM5Q9C035 493 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NYXQ9GZU5 481 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SPTLC3Q9NUV7 552 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 ABCF2Q9UG63 623 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 ANAPC4Q9UJX5 808 aa32.07■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 PPARAQ07869 468 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 TRIM29Q14134 588 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 KCNF1Q9H3M0 494 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 RAI14Q9P0K7 980 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NARFQ9UHQ1 456 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 WTAPQ15007 396 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SARM1Q6SZW1 724 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 WASF1Q92558 559 aa32.06■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NHSQ6T4R5 1651 aa32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 CMA1P23946 247 aa32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SDF4Q9BRK5 362 aa32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 ERICH2A1L162 156 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NGLY1Q96IV0 654 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 TOMM22Q9NS69 142 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 MYH6P13533 1939 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 KCNQ4P56696 695 aa32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 MYH2Q9UKX2 1941 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SEMA3EO15041 775 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 RPS6KA4O75676 772 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 CDC25BP30305 580 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 BICDL1Q6ZP65 573 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SLC26A6Q9BXS9 759 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 PPP6R2O75170 966 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 CEP57L1Q8IYX8 460 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 JMYQ8N9B5 988 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 KIAA1524Q8TCG1 905 aa32.03■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 RTN1Q16799 776 aa32.02■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 SDR42E1Q8WUS8 393 aa32.01■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
CERS1-201ENST00000429504 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa32.01■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 SETDB2Q96T68 719 aa32.01■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 KIAA1468Q9P260 1216 aa32.01■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 DUOX1Q9NRD9 1551 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 PTPAQ15257 358 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 FBXO33Q7Z6M2 555 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 TRIM22Q8IYM9 498 aa32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP32■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 ZNF202O95125 648 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 ESR2Q92731 530 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 NLRP3Q96P20 1036 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 MAP3K14Q99558 947 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 PFKFB1P16118 471 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 UBAC1Q9BSL1 405 aa31.99■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 BECN2A8MW95 431 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 PTGS1P23219 599 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 MAST2Q6P0Q8 1798 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 DRC7Q8IY82 874 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 TIGD1Q96MW7 591 aa31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.97■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa31.97■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 MINDY4BA8MYZ0 360 aa31.96■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 LY75O60449 1722 aa31.96■■■□□ 2.71
CERS1-201ENST00000429504 ZPR1O75312 459 aa31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms