RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 IFNAR1P17181 557 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 GNAT2P19087 354 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TUBB4BP68371 445 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 ELF2Q15723 593 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 NTRK3Q16288 839 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 RILPL1Q5EBL4 403 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 METTL24Q5JXM2 366 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SHC4Q6S5L8 630 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TMTC2Q8N394 836 aa19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 EFCAB8A8MWE9 144 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 STX10O60499 249 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SERPINC1P01008 464 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF3Q9H094 633 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 KCNH3Q9ULD8 1083 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC66A2RUB6 948 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8AA7E2F4 631 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 STARD3NLO95772 234 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 MCAMP43121 646 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SYT10Q6XYQ8 523 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.36■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 MROH5Q6ZUA9 1318 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CTSWP56202 376 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TUBB2AQ13885 445 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SCARF1Q14162 830 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TERF2Q15554 542 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CHRNA2Q15822 529 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 HOMER1Q86YM7 354 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D10CQ8IV04 446 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM22Q8IYM9 498 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CNNM3Q8NE01 707 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TUBB2BQ9BVA1 445 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 LY9Q9HBG7 655 aa19.35■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 BMP15O95972 392 aa19.34■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 SLFN14P0C7P3 912 aa19.34■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP100Q494V2 611 aa19.34■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 PDE8BO95263 885 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 PDE6AP16499 860 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 PTPREP23469 700 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 UBXN4Q92575 508 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.33■□□□□ 0.69
HCLS1-202ENST00000428394 BCORQ6W2J9 1755 aa19.33■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 UBN2Q6ZU65 1347 aa19.33■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.33■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 BIN1O00499 593 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 MMP1P03956 469 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM65Q6PJ69 517 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 REXO1L1PQ8IX06 675 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 MNS1Q8NEH6 495 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 LPIN2Q92539 896 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 PRDM11Q9NQV5 511 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 ERVV-1B6SEH8 477 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 SEMA3EO15041 775 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 DEXIO95424 95 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF18P17022 549 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 SARSP49591 514 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K12Q12852 859 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
HCLS1-202ENST00000428394 AIDAQ96BJ3 306 aa19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms