RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-210ENST00000425184 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 MED26O95402 600 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ERVK-24P63145 666 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CYP27A1Q02318 531 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 TTLL4Q14679 1199 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 GATA6Q92908 595 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 LGR6Q9HBX8 967 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 RASIP1Q5U651 963 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 TMC4Q7Z404 712 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 SHISA5Q8N114 240 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 PICK1Q9NRD5 415 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 FAM170BA6NMN3 283 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 FOSL1P15407 271 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 RNF214Q8ND24 703 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CYP26A1O43174 497 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 NEFMP07197 916 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 SPINK2P20155 84 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 LMNB1P20700 586 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ITGAEP38570 1179 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 FAM161BQ96MY7 647 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 MRS2Q9HD23 443 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 SORBS3O60504 671 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CDK5R2Q13319 367 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 DTX1Q86Y01 620 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 HOMEZQ8IX15 550 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ISL2Q96A47 359 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CSADQ9Y600 493 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 RLBP1P12271 317 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 PPM1JQ5JR12 505 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 C12orf40Q86WS4 652 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 CRELD1Q96HD1 420 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-210ENST00000425184 FANCGO15287 622 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 FAM87AP0C7U9 286 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 RING1Q06587 406 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 MAP3K11Q16584 847 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 MSMPQ1L6U9 139 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 HDXQ7Z353 690 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 WNT11O96014 354 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 CTSHP09668 335 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 LIG3P49916 1009 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 USP31Q70CQ4 1352 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 NTF4P34130 210 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 INPP5AQ14642 412 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 KCT2Q8NC54 265 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 BCL11AQ9H165 835 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 SEPT6Q14141 434 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-210ENST00000425184 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.74□□□□□ -1.33
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