RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 TRIM37O94972 964 aa9.91□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 CELA3AP09093 270 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 ERVK-24P63145 666 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 TTLL4Q14679 1199 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.9□□□□□ -0.82
TRPS1-204ENST00000422939 DAB2P98082 770 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 CYP27A1Q02318 531 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 RASIP1Q5U651 963 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 LGR6Q9HBX8 967 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 FAM170BA6NMN3 283 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 RNF214Q8ND24 703 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 FOSL1P15407 271 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 SPINK2P20155 84 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 PSMD2Q13200 908 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 DTX1Q86Y01 620 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 TMC4Q7Z404 712 aa9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 CYP26A1O43174 497 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 NEFMP07197 916 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 RING1Q06587 406 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 ISL2Q96A47 359 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-204ENST00000422939 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PPM1JQ5JR12 505 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 C12orf40Q86WS4 652 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 CSADQ9Y600 493 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 CDK5R2Q13319 367 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 MSMPQ1L6U9 139 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 FAM161BQ96MY7 647 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 FANCGO15287 622 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 CTSHP09668 335 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 USP31Q70CQ4 1352 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 SORBS3O60504 671 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ADAMTS4O75173 837 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 WNT11O96014 354 aa9.8□□□□□ -0.84
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TRPS1-204ENST00000422939 NTF4P34130 210 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PICK1Q9NRD5 415 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 INPP5AQ14642 412 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 RLBP1P12271 317 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ITGAEP38570 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 LIG3P49916 1009 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 HDXQ7Z353 690 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 MRS2Q9HD23 443 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-204ENST00000422939 PRNPP04156 253 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 LMNB1P20700 586 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 MAP3K11Q16584 847 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 KCT2Q8NC54 265 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 CRELD1Q96HD1 420 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 LEFTY1O75610 366 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 SEPT6Q14141 434 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 HOMEZQ8IX15 550 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-204ENST00000422939 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.74□□□□□ -0.85
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