RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE1AP54750 535 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 TCP10Q12799 353 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.02□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 TNNI3KQ59H18 835 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL10Q6JEL2 608 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 MICU3Q86XE3 530 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP57Q86XR8 500 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 C10orf67Q8IYJ2 551 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 USP40Q9NVE5 1235 aa5.02□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa5.02□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 STIM1Q13586 685 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SKAP1Q86WV1 359 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 TAF4BQ92750 862 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NEK1Q96PY6 1258 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SAMM50Q9Y512 469 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SSH2Q76I76 1423 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 MBD4O95243 580 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SYCP1Q15431 976 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 RAD17O75943 681 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF853P0CG23 659 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CETN2P41208 172 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SLC15A2Q16348 729 aa5.01□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 SPECC1Q5M775 1068 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP10Q86W26 655 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 C8orf76Q96K31 380 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 KDRP35968 1356 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 PIK3C2BO00750 1634 aa5.01□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 A6NNZ2 444 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 PAFAH1B1P43034 410 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT85P78386 507 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA5Q8NB90 893 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SPC24Q8NBT2 197 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAI2Q9GZS0 605 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 DCTPP1Q9H773 170 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 DBNDD1Q9H9R9 158 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.617e-7■■■□□ 18.9
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC5A4Q9NY91 659 aa5□□□□□ -1.61
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ANKRD28-202ENST00000412318 CASZ1Q86V15 1759 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 IQCA1LA6NCM1 817 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CALM1P0DP23 149 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CALM2P0DP24 149 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CALM3P0DP25 149 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 GYG1P46976 350 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 IFFO1Q0D2I5 559 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC22Q5TAA0 569 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP120Q8N960 986 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 COL15A1P39059 1388 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 SMTNL1A8MU46 457 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBTB43O43298 467 aa5□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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