RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412307.3

C10orf55-202, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene C10orf55, Length 2,360 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-202ENST00000412307 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 USP17L12C9JPN9 530 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 USP17L21D6R901 530 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 GUCY1B3Q02153 619 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 RNF214Q8ND24 703 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 PDE6BP35913 854 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CTR9Q6PD62 1173 aa24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 LY9Q9HBG7 655 aa24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CYP2D6P10635 497 aa24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CHRNA5P30532 468 aa24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 H3BQV1 296 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 IL1R1P14778 569 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 HS1BP3Q53T59 392 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 IFFO2Q5TF58 517 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 MICU3Q86XE3 530 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 FBXO41Q8TF61 875 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 STK32BQ9NY57 414 aa24.6■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 DOK7Q18PE1 504 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 MASTLQ96GX5 879 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 KRT23Q9C075 422 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 MPNDQ8N594 471 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 FBXW7Q969H0 707 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CDC27P30260 824 aa24.58■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 ALDH1B1P30837 517 aa24.58■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 APOA5Q6Q788 366 aa24.58■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.58■■□□□ 1.53
C10orf55-202ENST00000412307 GTF2IP78347 998 aa24.58■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.58■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM87BQ96K49 555 aa24.58■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 MXD3Q9BW11 206 aa24.58■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.58■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 USP17L8P0C7I0 530 aa24.57■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CHD4Q14839 1912 aa24.57■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 OFD1O75665 1012 aa24.57■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CPLX1O14810 134 aa24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 PHKBQ93100 1093 aa24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.55■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 F8W031 263 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 H0YIN7 160 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ZBTB43O43298 467 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TMC4Q7Z404 712 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 AIFM3Q96NN9 605 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TSPY26PQ9H489 355 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 UTRNP46939 3433 aa24.54■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC69A6NI79 296 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 USP5P45974 858 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 RESTQ13127 1097 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 WTAPQ15007 396 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.53■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 LIFRP42702 1097 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 LTBP1Q14766 1721 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 NMT2O60551 498 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.52■■□□□ 1.52
C10orf55-202ENST00000412307 ESR2Q92731 530 aa24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms