RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 IL25Q9H293 177 aa15.99■□□□□ 0.15
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LIMS1-204ENST00000409441 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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LIMS1-204ENST00000409441 FAM151AQ8WW52 585 aa15.93■□□□□ 0.14
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LIMS1-204ENST00000409441 USP17L21D6R901 530 aa15.91■□□□□ 0.14
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LIMS1-204ENST00000409441 ALX1Q15699 326 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 NAPBQ9H115 298 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-204ENST00000409441 CTR9Q6PD62 1173 aa15.9■□□□□ 0.14
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