RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 TMTC2Q8N394 836 aa10.96□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CUTAO60888 179 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 POSTNQ15063 836 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZNF174Q15697 407 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MTUS1Q9ULD2 1270 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF11O15085 1522 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PAK1Q13153 545 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TAOK1Q7L7X3 1001 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MTMR3Q13615 1198 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 KMT5BQ4FZB7 885 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 VPS52Q8N1B4 723 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC151A5D8V7 595 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZMYND10O75800 440 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TADA2BQ86TJ2 420 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TCP11Q8WWU5 503 aa10.95□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SESN3P58005 492 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 G2E3Q7L622 706 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 USP28Q96RU2 1077 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FANCLQ9NW38 375 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 IFT140Q96RY7 1462 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WWV3 80 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RASIP1Q5U651 963 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ESR2Q92731 530 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ALDH1L1O75891 902 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PTPN21Q16825 1174 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC174Q6PII3 467 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PFKFB1P16118 471 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SEL1L2Q5TEA6 688 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ADALQ6DHV7 355 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.94□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PFDN1O60925 122 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ATF3P18847 181 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PSMC4P43686 418 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MAP7Q14244 749 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 NOS1P29475 1434 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SLC35F6Q8N357 371 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC110Q8TBZ0 833 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CCDC51Q96ER9 411 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 NUP58Q9BVL2 599 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PDE4BQ07343 736 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TNIP1Q15025 636 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STAMQ92783 540 aa10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 ARID5BQ14865 1188 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STX8Q9UNK0 236 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 RGS12O14924 1447 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 TOPBP1Q92547 1522 aa10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
HERC3-202ENST00000402738 STX10O60499 249 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms