RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397317.8

CLDN7-202, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-202ENST00000397317 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 UNCXA6NJT0 531 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 ECE1P42892 770 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 PRKG1Q13976 671 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 DCAF15Q66K64 600 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 FSD1Q9BTV5 496 aa21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLDN7-202ENST00000397317 MYH7P12883 1935 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 RGMBQ6NW40 437 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 MOB2Q70IA6 237 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 TICAM2Q86XR7 235 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CSRNP1Q96S65 589 aa21.51■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 PDE4AP27815 886 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 FLT1P17948 1338 aa21.5■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 USP5P45974 858 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 APPBP2Q92624 585 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CCDC102AQ96A19 550 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CAPNS2Q96L46 248 aa21.49■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 MBD4O95243 580 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 VEGFBP49765 207 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 LCORLQ8N3X6 602 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 AIDAQ96BJ3 306 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 FZD1Q9UP38 647 aa21.48■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 ARMT1Q9H993 441 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 FOCADQ5VW36 1801 aa21.47■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CHGBP05060 677 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 AK9Q5TCS8 1911 aa21.46■■□□□ 1.03
CLDN7-202ENST00000397317 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 MAP3K9P80192 1104 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 MAP3K10Q02779 954 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 GRM1Q13255 1194 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 RILPL2Q969X0 211 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 WRNIP1Q96S55 665 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.45■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 TBC1D12O60347 775 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 HLA-DOAP06340 250 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 SLC10A3P09131 477 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 NOGQ13253 232 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 OSBP2Q969R2 916 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 CSADQ9Y600 493 aa21.44■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 MAP2K2P36507 400 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 TTC22Q5TAA0 569 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 PALD1Q9ULE6 856 aa21.43■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 GNAT2P19087 354 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 TTC6Q86TZ1 520 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 SDR42E1Q8WUS8 393 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.42■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 GPAA1O43292 621 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 VGLL4Q14135 290 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.41■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 OTOFQ9HC10 1997 aa21.4■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 M0R2C6 588 aa21.4■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 HIP1O00291 1037 aa21.4■■□□□ 1.02
CLDN7-202ENST00000397317 PRKAB2O43741 272 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms