RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.6■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.59■□□□□ 0.57
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PGGT1B-202ENST00000379615 CAPNS2Q96L46 248 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 TSKSQ9UJT2 592 aa18.59■□□□□ 0.57
PGGT1B-202ENST00000379615 MAST2Q6P0Q8 1798 aa18.59■□□□□ 0.57
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PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.58■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.56■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 FSD1Q9BTV5 496 aa18.56■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.56■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.56■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.54■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.53■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 FLT1P17948 1338 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D12O60347 775 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD4O95243 580 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC6Q86TZ1 520 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
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PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 FZD1Q9UP38 647 aa18.52■□□□□ 0.56
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K10Q02779 954 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RASAL3Q86YV0 1011 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMT1Q9H993 441 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 GNAT2P19087 354 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 LCORLQ8N3X6 602 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 RILPL2Q969X0 211 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 PALD1Q9ULE6 856 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH7P12883 1935 aa18.5■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 VGLL4Q14135 290 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRYD7Q5W111 196 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.49■□□□□ 0.55
PGGT1B-202ENST00000379615 ZIC5Q96T25 663 aa18.49■□□□□ 0.55
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