RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STX17P56962 302 aa18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RXRAP19793 462 aa18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GPR108Q9NPR9 543 aa18.27■□□□□ 0.52
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.27■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.27■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.517e-6■■■■□ 21.3
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.27■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GTF3C6Q969F1 213 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DRC1Q96MC2 740 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERO1AQ96HE7 468 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STAP2Q9UGK3 403 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BEND3Q5T5X7 828 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IL17REQ8NFR9 667 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.26■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTSWP56202 376 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KRT40Q6A162 431 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TCHPQ9BT92 498 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 E7EWF7 191 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLAIN2Q9P270 581 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE6BP35913 854 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE4DQ08499 809 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NLRP1Q9C000 1473 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HSPA2P54652 639 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PAK1Q13153 545 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.25■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RIMBP2O15034 1052 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HAUS7Q99871 368 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RBSNQ9H1K0 784 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAF5O00463 557 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF202O95125 648 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZAP70P43403 619 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADCY7P51828 1080 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIFAP3Q92845 792 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IGSF1Q8N6C5 1336 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMTNP53814 917 aa18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF75DP51815 510 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UBE4AQ14139 1066 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLUL1Q15846 466 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 COPRSQ9NQ92 184 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 A0A1W2PRG0 241 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LMBRD1Q9NUN5 540 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CETN3O15182 167 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FANCCQ00597 558 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF1BO60333 1816 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TERF1P54274 439 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.23■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CIAO1O76071 339 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TICAM2Q86XR7 235 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 STK32BQ9NY57 414 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RGS12O14924 1447 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARHGAP6O43182 974 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LTKP29376 864 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ADALQ6DHV7 355 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GALNT17Q6IS24 598 aa18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PFKFB2O60825 505 aa18.21■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.21■□□□□ 0.51
HS3ST3B1-201ENST00000360954 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms