RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 VPS33BQ9H267 617 aa28.16■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.16■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 PRC1O43663 620 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 RHBDL3P58872 404 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 CYB5R4Q7L1T6 521 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.15■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 PLCG2P16885 1265 aa28.14■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 ST3GAL1Q11201 340 aa28.14■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.14■■■□□ 2.1
TMIE-201ENST00000326431 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 EVX2Q03828 476 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 TEX11Q8IYF3 940 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 FBXL16Q8N461 479 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 USP17L8P0C7I0 530 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 SBK1Q52WX2 424 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 NECAB1Q8N987 351 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.13■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 NFKBIEO00221 500 aa28.12■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CYP2D6P10635 497 aa28.12■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 TEKT1Q969V4 418 aa28.12■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 KRT23Q9C075 422 aa28.12■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 APOBRQ0VD83 1088 aa28.11■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 CRKP46108 304 aa28.11■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28.11■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 TOMM22Q9NS69 142 aa28.11■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 KDM4AO75164 1064 aa28.1■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 STK3Q13188 491 aa28.1■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 NIM1KQ8IY84 436 aa28.1■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 ZSWIM5Q9P217 1185 aa28.1■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 RAD17O75943 681 aa28.09■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.09■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 MRIQ9BWK5 157 aa28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 FLT1P17948 1338 aa28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 C12orf60Q5U649 245 aa28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TMIE-201ENST00000326431 PSMD14O00487 310 aa28.07■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 FGRP09769 529 aa28.07■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.07■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.07■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 EVCP57679 992 aa28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 GTF3C6Q969F1 213 aa28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 TMEM87BQ96K49 555 aa28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 USP40Q9NVE5 1235 aa28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.05■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 DTNBO60941 627 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PRDM1O75626 825 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 RASSF7Q02833 373 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PFKFB2O60825 505 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ESR2Q92731 530 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SCRN1Q12765 414 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PKP1Q13835 747 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 GMLQ99445 158 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.03■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.02■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 ORC4O43929 436 aa28.02■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PLCD1P51178 756 aa28.02■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 PICALMQ13492 652 aa28.02■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 JDP2Q8WYK2 163 aa28.02■■■□□ 2.08
TMIE-201ENST00000326431 LY9Q9HBG7 655 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms