RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GUCY1B3Q02153 619 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF790Q6PG37 636 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRAPQ7Z569 592 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERLIN2O94905 339 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP2K2P36507 400 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIP4K2BP78356 416 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OLFM4Q6UX06 510 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRC1P22897 1456 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF5CO60282 957 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FANCLQ9NW38 375 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNF40O75150 1001 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WDR93Q6P2C0 686 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDILTQ8N807 584 aa20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOM1O60784 492 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANXA1P04083 346 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHACTR2O75167 634 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ISM2Q6H9L7 571 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BANK1Q8NDB2 785 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DESI2Q9BSY9 194 aa20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYKP43405 635 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PANX2Q96RD6 677 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PHLPP1O60346 1717 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HPSEQ9Y251 543 aa20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTAGE8P0CG41 777 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CABP4P57796 275 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANO1Q5XXA6 986 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KAT2BQ92831 832 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF609O15014 1411 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CTAGE9A4FU28 777 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EXOC5O00471 708 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRR29P0C7W0 189 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPN21Q16825 1174 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PROSER3Q2NL68 480 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF18P17022 549 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POTEDQ86YR6 584 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP5JP18859 108 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MNAT1P51948 309 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXL16Q8N461 479 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C8orf76Q96K31 380 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADAMTS2O95450 1211 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SLC39A14Q15043 492 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MCM3P25205 808 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PNOCQ13519 176 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUFUQ9UMX1 484 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UTYO14607 1347 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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