RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 WDR62O43379 1518 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.384e-9■■■■□ 19.9
CCSAP-201ENST00000284617 PAK1Q13153 545 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C6Q969F1 213 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 A6NNZ2 444 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 BRD1O95696 1058 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC114Q96M63 670 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0232Q92628 1395 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TTC38Q5R3I4 469 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 PDE8AO60658 829 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TEX11Q8IYF3 940 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 ARMT1Q9H993 441 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM3Q14202 1370 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf74Q6P047 294 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CERS3Q8IU89 383 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SETDB1Q15047 1291 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC25Q86WR0 208 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0556O60303 1618 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SUCLG2Q96I99 432 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC63Q8NA47 563 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM23A6NLE4 172 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CETN3O15182 167 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KRT40Q6A162 431 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CARD6Q9BX69 1037 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D4AQ9H788 454 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA6P17658 529 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5DP30049 168 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 GCKRQ14397 625 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 SSH2Q76I76 1423 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CSRNP2Q9H175 543 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 KIFAP3Q92845 792 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa23.65■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 CEP57Q86XR8 500 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 VEZTQ9HBM0 779 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 STK24Q9Y6E0 443 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 LPIN2Q92539 896 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 NOX5Q96PH1 765 aa23.64■■□□□ 1.38
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP3P21580 790 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 POSTNQ15063 836 aa23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5JP18859 108 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH3A1P30838 453 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 KRT9P35527 623 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 PLS1Q14651 629 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.63■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 IFT20Q8IY31 132 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC4O15439 1325 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SPOPO43791 374 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 STIM2Q9P246 746 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.62■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 IGSF3O75054 1194 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 ASIC2Q16515 512 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 WDR44Q5JSH3 913 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 FAM212AQ96EL1 285 aa23.61■■□□□ 1.37
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1260.2 ms