RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.59□□□□□ -1.03
SMARCE1-201ENST00000264640 CHL1O00533 1208 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CASC1Q6TDU7 716 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 PODNQ7Z5L7 613 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ELP3Q9H9T3 547 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 MED23Q9ULK4 1368 aa8.58□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 AOX1Q06278 1338 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 VCANP13611 3396 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CLRN2A0PK11 232 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP2B4P23634 1241 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K11Q16584 847 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX21Q969T3 373 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 OPTNQ96CV9 577 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 EPAS1Q99814 870 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 LNPKQ9C0E8 428 aa8.57□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC45O75419 566 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 KLRK1P26718 216 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB123Q8N688 67 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPYL6Q8N831 410 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 STK31Q9BXU1 1019 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 VEZTQ9HBM0 779 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 STAP2Q9UGK3 403 aa8.56□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 F8W031 263 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF6Q15052 776 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 DLGAP5Q15398 846 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL15Q16663 113 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD44Q8N8A2 993 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 DCTPP1Q9H773 170 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 EYSQ5T1H1 3165 aa8.55□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL5P13501 91 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CTGFP29279 349 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2IP78347 998 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.54□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPC1 479 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 GNAI3P08754 354 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 GJA8P48165 433 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF22Q14807 665 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 CERS5Q8N5B7 392 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 IL27Q8NEV9 243 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 COA1Q9GZY4 146 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF208Q9H0X6 261 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DPYSL4O14531 572 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE8AO60658 829 aa8.52□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GRK4P32298 578 aa8.52□□□□□ -1.05
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